Фамилия Колончук — характерный пример украинской модели фамилий на -ук/-чук, которая распространена в западных и центральных областях Украины. Формант -чук в таких фамилиях обычно означает «сын» или «потомок»: Колончук — это буквально «сын Колона» или «маленький Колон». Суффикс -чук, в отличие от -ук, чаще встречается на Волыни, Подолье и в Галиции, и указывает на более молодое поколение или уменьшительность.

Основа фамилии — прозвище Колон. Его происхождение неочевидно, и здесь возможны два основных пути. Первый: от слова «колон» в значении «колонна» или «столб». В украинских говорах «колон» могло относиться к высокому, прямому человеку, либо к тому, кто жил у столба, межевого знака. Второй, более правдоподобный вариант: прозвище связано с польским словом «kolon» — «поселенец», «колонист». В XVI–XVIII веках на Правобережной Украине существовали колонии — поселения крестьян, которых сажали на землю помещики. Такого человека могли прозвать Колоном, а его потомков — Колончуками.

Встречается и редкая версия, что Колончук может быть производным от имени Николай через его уменьшительную форму Колон (как вариант Коля), но это менее вероятно: украинская традиция скорее дала бы фамилию Кольчук или Колячук. Географически фамилия сегодня сосредоточена в Тернопольской, Хмельницкой и Ровенской областях, что подтверждает западноукраинский ареал распространения. В документах XIX века Колончуки чаще всего числились крестьянами или мещанами, то есть фамилия не принадлежала к шляхетским или старшинским родам.

Словообразовательно фамилия прозрачна: корень Колон- плюс патронимический суффикс -чук. Ударение в современном русском и украинском языке падает на последний слог — Колончу́к. Если сравнивать с однокоренными, то в той же модели есть фамилии Колонюк, Колонько, Колоненко — все они восходят к тому же прозвищу Колон, но различаются суффиксами, указывающими на регион и время образования.