Фамилия Колонин образована от прозвища Колоний. По одной из версий, оно ведет свое начало от гидронима Колона (или Калана) — речка, правый приток Большого Чембара, окружена степными липягами. Сам гидроним, по одной из версий, восходит к татарскому «колан» - «дикая лошадь» или же «кёлле» - «зола, зольный». Возможно также, что гидроним ведет свое начало от русского устаревшего слова «коломь» - «окрестность; то, что около чего-либо». Согласно еще одной точке зрения, гидроним образован от мордовского «кал» - «рыба». Вероятно, основатель фамилии родился или жил на берегу речки Колоны. По другой гипотезе, в основу прозвища Колоний легло нарицательное «колония» - «население иноземцев, поселок выходцев, переселенцы из другой земли». В таком случае Колоним могли называть иноземца. Наконец, нельзя исключить, что прозвище Колоний связано со словом «колона» - «род древовидных растений семейства липовых». Прочное волокно колоны применяется для выделки канатов, из коры колоны делают очень прочный текстиль. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Колоний, со временем получил фамилию Колонин.