Козюканова — фамилия, которая сразу приковывает внимание необычным звучанием. Она явно происходит от прозвища или имени, а суффикс «-ов» указывает на принадлежность: буквально «сын (или потомок) Козюкана». Основа фамилии — Козюкан — скорее всего, образована от имени Козьма (народная форма Кузьма) с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса «-юк» (как в фамилиях Козюк, Козюлин) и дополнительного «-ан». Получается, что Козюкан — это ласковое или пренебрежительное прозвище человека по имени Кузьма, вроде «Кузька» или «Козюля». Такая словообразовательная модель характерна для русских фамилий, где к основе добавляли сразу два суффикса, чтобы подчеркнуть неформальное, домашнее обращение.

Впрочем, есть и вторая версия, менее очевидная, но правдоподобная для южных регионов. В украинском и белорусском языках «козюка» может означать «коза» или «козлёнок» (сравните с диалектным «козюля» — косуля, дикая коза). Тогда Козюкан — прозвище пастуха, владельца коз или просто человека с упрямым, «козлиным» характером. Суффикс «-ан» в этом случае придаёт прозвищу оттенок просторечия, как в словах «болван», «грубиян». Такие прозвища часто давали в крестьянской среде, и они легко закреплялись в качестве фамилий.

Фамилия редкая, географически тяготеет к югу России, а также к Украине и Белоруссии. Встречается в Курской, Белгородской, Воронежской областях — там, где исторически сильны украинские говоры и смешение культур. Сословно предки Козюкановых, скорее всего, были крестьянами или однодворцами (государственными крестьянами, жившими на южных границах). Дворянских родов с такой фамилией нет, что подтверждает её народное, прозвищное происхождение.

Особенность написания — окончание «-ова», а не «-ева». Это типично для фамилий, образованных от основ на твёрдый согласный: Козюкан → Козюканов. Если бы основа оканчивалась на мягкий или шипящий, было бы «-ев» (например, Козюканев). Эта деталь лишний раз подсказывает, что прозвище звучало именно как «Козюкан», а не «Козюкань».