Фамилия Кпупа — один из тех редких случаев, когда написание говорит о происхождении громче, чем звучание. Сочетание «кп» в начале слова для русского языка нетипично: исконные слова так не начинаются. Это почти всегда признак заимствования или искусственного переосмысления при записи.

Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища или имени, которое в устной речи звучало иначе, но при оформлении документов получило необычную графику. Самый вероятный источник — украинская или южнорусская основа «купа» (куча, стог, группа людей). В диалектах «купа» означала и «копна сена», и «толпа». Прозвище Купа могли дать либо крепкому, коренастому человеку (как стог), либо тому, кто жил в многолюдной семье или часто бывал в гуще народа. Фамилия Купа существует и сейчас, но написание Кпупа могло возникнуть из-за диалектного произношения: в некоторых говорах начальное «ку» редуцировалось до «к», и на слух слово воспринималось как «кпа». При записи малограмотный писарь, стараясь передать услышанное, мог вывести «Кпупа» — с вставной «п» для удобства произнесения.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная, — связь с польским или белорусским словом «kupa» в значении «куча, груда». В этом случае фамилия могла быть прозвищем сборщика податей, сторожа на гумне или просто неряшливого человека. Однако суффикс -а (Кпупа — это форма именительного падежа, а не типичное -ов/-ин) указывает на то, что фамилия закрепилась в форме прозвища без дополнительных патронимических окончаний. Такие «голые» фамилии чаще встречаются на западе и юге России, в Беларуси и на Украине.

Географически фамилия Кпупа крайне редка. Она почти не встречается в центральных и северных регионах, что подтверждает её диалектное и, скорее всего, западно- или южнорусское происхождение. Поскольку носителей мало, говорить о сословной принадлежности предков сложно. Скорее всего, это были крестьяне или мещане, получившие фамилию по уличному прозвищу при переписях XIX века. Необычное написание не делает её «благородной» или «древней» — оно просто отражает живой процесс народной этимологии и особенности местного говора, которые застыли в документе.