Фамилия Крапопов звучит необычно, и её разбор сразу ставит вопрос: что за корень «крапоп»? Ответ лежит в области диалектной лексики и народного словообразования. Скорее всего, в основе лежит не имя, а прозвище или профессия, связанная с глаголом «крапать» — то есть «капать», «накрапывать» (о дожде), а также «делать крапинки», «наносить мелкие пятна». В русских говорах «крапоп» или «крапап» могло означать человека, который занимается краплением — нанесением узора из точек, например, на ткань, посуду или даже на игральные карты. Картёжники знают «краплёные карты»; отсюда прозвище Крапоп мог получить шулер или мастер, помечавший колоды.

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую патронимическую модель: Крапопов — это «сын Крапопа». Фамилия образована не от крестильного имени, а от прозвища, что типично для поздних (XVII–XIX века) фамилий крестьян и посадских людей. Интересно, что форма «Крапоп» встречается редко; гораздо чаще в ономастике фиксируется фамилия Крапов (от «крап» — мелкое пятно, крапинка). Удвоение «по» в корне — «Крапоп» вместо «Крап» — могло возникнуть как диалектное стяжение или под влиянием других прозвищ на -оп (например, Хлопот, Топот).

Географически фамилия Крапопов — одна из самых редких. Она почти не встречается в центральных областях России, но единичные носители зафиксированы в северных и сибирских регионах, где хорошо сохранялись диалектные прозвища. В переписных книгах XVII века и в справочнике Веселовского «Ономастикон» аналогов не найдено, что говорит о локальном, возможно, однодворном происхождении.

Есть и спорная версия: корень мог восходить к тюркскому «крап» (ворон) или к финно-угорскому «краппа» (короста, струп), но она маловероятна — суффикс -ов и отсутствие фамилий-аналогов в тех языках делают её натяжкой. Правдоподобнее всего связь с ремеслом красильщика или карточного мастера, а сама фамилия — один из тех редких случаев, когда прозвище сохранилось в почти неизменном виде, не перейдя в более привычную форму.