Фамилия Крисаченко звучит характерно для украинской ономастики. Её выдает суффикс -енко, который в XVI–XVII веках закрепился в Поднепровье как главный показатель патронимической фамилии — «сын такого-то». Носитель Крисаченко — это потомок человека по имени или прозвищу Крисач.

Основа фамилии неочевидна. Самое прямое объяснение: Крисач — это производное от крестильного имени Кир (греч. kyrios — «господин, владыка»). В народной речи имя Кир могло дать формы Кирса, а далее — Кирсач с последующим упрощением «ир» в «ри» (явление, известное в диалектах как метатеза). Тогда Крисаченко — «внук (или сын) Кирсача», то есть потомок человека, которого в быту звали по отцу Киром.

Версия с прозвищем тоже имеет право на существование. В южнорусских и украинских говорах «крис» или «криса» — это разновидность ножа или засапожника, а также режущий инструмент для щепы (лучения лучины). Человек, делавший такие ножи или работавший с ними, мог получить прозвище Крисач. Однако эта версия менее вероятна: прозвище по орудию труда обычно закреплялось за мастером (Ножов, Топоров), а форма Крисач для такого случая редка.

В польском языке есть слово «krysa» — край, кайма, оторочка. Если фамилия имеет западное происхождение, Крисачем могли назвать портного, который специализировался на отделке одежды. Но для украинской фамилии с суффиксом -енко это скорее экзотика.

Таким образом, наиболее правдоподобно, что Крисаченко — патронимическая фамилия от канонического имени Кир через промежуточную форму Кирсач. Географически она тяготеет к центральным и левобережным областям Украины — Полтавщине, Черкащине, Киевщине, где фамилии на -енко особенно распространены. Встречается и в России, куда попала вместе с миграцией малороссийского казачества и крестьян в XVIII–XIX веках.