Фамилия Крисеева — женская форма, мужская — Крисеев. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Крисей, а оно, скорее всего, восходит к слову «крисать» или «крисить». В северных и сибирских говорах «крисать» означало «бить, колотить», а в рязанских и тульских — «резать, крошить». Человек, получивший прозвище Крисей, мог быть драчуном, забиякой либо, наоборот, мясником или портным — тем, кто постоянно что-то кроит и режет.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным «криса» — так в некоторых областях называли зайца. Тогда Крисей — прозвище быстрого, пугливого или длинноухого человека. Однако в ономастике чаще встречается версия, отталкивающаяся от глагола, — она объясняет и суффикс -ей, который в русских прозвищах нередко указывал на деятеля (ср. Болтай, Ломай, Стреляй).

Фамилия образована по стандартной модели: основа Крисей плюс притяжательный суффикс -ев. Такие фамилии типичны для центральной России и Поволжья, где суффикс -ев присоединяли к основам на мягкий согласный или -й. Встречается Крисеева нечасто, что говорит о локальном бытовании исходного прозвища.

Сравните с однокоренными фамилиями: Крисанов (от Крисан — вариант имени Хрисанф), Крисаев (от Крисай). У Крисеева иной суффикс, а значит, иная история — не от церковного имени, а от живого народного прозвища. За этим стоит не календарный святой, а конкретный человек с характером или профессией, которые запомнились окружающим.