Фамилия Крнатян — яркий пример армянской модели образования фамилий, и её разбор стоит начать именно с суффикса. В русском языке эта фамилия, скорее всего, не имеет славянских корней. Суффикс -ян (в старой орфографии также -ьянц) — один из самых распространённых в армянской ономастике. Он указывает на принадлежность к роду, происхождение: буквально «из дома такого-то», «потомок такого-то». Аналог в русских фамилиях — суффиксы -ов/-ев или -ин.

Основа фамилии — Крнат (или Крнад). Это, скорее всего, прозвище или ремесленное имя. В армянском языке слово «крнат» (գռնատ) означает «горшечник», «гончар». Гончарное дело в Армении было одним из древнейших и уважаемых ремёсел, особенно в регионах, богатых глиной (например, в Гюмри, Вагаршапате). Соответственно, предок носителя фамилии Крнатян, по всей вероятности, был мастером по изготовлению глиняной посуды — кувшинов, пифосов для вина и масла.

Есть и другая, менее распространённая версия. В некоторых диалектах армянского языка «крнат» могло быть прозвищем, связанным с внешностью или характером. Однако в контексте фамилий, образованных от названий профессий, версия с гончаром выглядит убедительнее: она конкретна и имеет прямые параллели с другими армянскими фамилиями-ремеслами (Дарбинян — кузнец, Восканян — ювелир, и т.д.).

Таким образом, фамилия Крнатян — это «род потомков горшечника». Она не имеет отношения к русским дворянским или крестьянским фамилиям, а принадлежит к армянской традиции, где фамилия часто рассказывала о деле, которым занималась семья из поколения в поколение.