Фамилия Кршко — редкая, и её происхождение неочевидно для русского уха. Скорее всего, перед нами не исконно русская, а западнославянская фамилия. Основной ключ — в суффиксе «-ко». В украинском, белорусском и польском языках этот суффикс выполняет две функции: уменьшительно-ласкательную (как в фамилиях Шевченко, Ковалько) или указывает на «сына», «потомка» (аналог русского «-ович»). Таким образом, Кршко — это либо «маленький Крш», либо «сын Крша».

Корень «Крш-» в славянских языках имеет несколько значений. Самое вероятное — от слова «крш» (или «кршан»), которое в польском и словацком означает «крест». В таком случае Кршко — это прозвище человека, связанного с крестом: крестьянина, ставившего кресты на полях, мастера по изготовлению крестов, либо человека, жившего у придорожного креста. В сербохорватском языке «крш» означает «карст», «каменистая почва», и фамилия могла возникнуть как топонимическая — от названия местности (например, словенский город Кршко, откуда мог быть родом человек).

Менее вероятна, но возможна версия от чешского «kršit» — «ломать, крушить» (ср. русское «крушить»). Тогда прозвище Кршко мог получить человек с крутым нравом или, наоборот, ломовой извозчик, ломающий камни. Однако эта гипотеза слабее, так как глагольные корни реже образуют фамилии с суффиксом «-ко».

География фамилии сегодня — преимущественно Словения, Хорватия и южные регионы Польши. В России Кршко встречается единично, чаще всего у потомков переселенцев из Западной Украины или Польши. В отличие от фамилий на «-ко», которые в русской среде часто русифицировались (Ковалько → Ковальков), Кршко сохранила исходную форму, что указывает на её позднее появление в России — скорее всего, в XX веке.

Единственного толкования нет, но наиболее обоснованным выглядит связь с крестом или каменистой местностью. Если ваши предки были из Западной Украины или Польши, фамилия почти наверняка означала «крестик» или «сын крестьянина, ставившего кресты». Если из Балкан — указывала на родом из каменистого края.