Фамилия Крыжачковский относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от личного прозвища. Так, фамилия Крыжачковский ведет свое начало от прозвища Крыжачко. Скорее всего, прозвище Крыжачко восходит к польскому слову krzyz («крыж») – «крест». Кроме того, на Украине так нередко называли и католика. По другой версии, прозвище Крыжачко происходит от украинского слова «крижень» - «большая дикая утка». Можно предположить, что прозвище Крыжачко получил охотник на уток или человек, который чем-либо напоминал эту птицу (например, походкой). Позже прозвище Крыжачко, изначально присоединенное к наследственному имени, полностью заменило его как в повседневной жизни, так и в официальных документах. В результате чего это прозвище стало основой для фамилии Крыжачковский. О точном месте и времени возникновения фамилии Крыжачковский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Крыжачковский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.