Фамилия Ксантос — редкий случай в русском ономастиконе. Она не славянского, а греческого происхождения, и в России почти не встречается. Её основа — греческое слово ξανθός (ксантос), что означает «светлый, русый, золотистый». В Древней Греции это было распространённое личное имя или прозвище для человека со светлыми волосами или светлой кожей, что на юге Европы всегда выделялось.

В русский язык фамилия попала, скорее всего, через греков, переселившихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках. Это могли быть купцы, моряки, священники или преподаватели. В отличие от типичных русских фамилий на -ов, -ин или -ский, Ксантос осталась без суффикса — в форме чистой основы, как и многие фамилии греческого происхождения (например, Диоген, Феофан). В документах её могли записать как Ксантос, Ксанф или, реже, Ксантов, адаптируя под местное произношение.

Словообразовательно фамилия простая: корень «ксант-» и окончание «-ос», характерное для греческих имён существительных мужского рода. Никаких русских суффиксов принадлежности здесь нет — это прямое заимствование. В современной Греции фамилия Ксантос встречается, но не входит в число самых распространённых. В России её носители — потомки тех самых греческих переселенцев, которые обосновались в Причерноморье, на Кубани или в крупных городах.

Если искать параллели, то в русском языке есть фамилия Ксанф (от того же корня), а также научные термины вроде «ксантофилл» (жёлтый пигмент). Но Ксантос — это именно фамилия-прозвище по внешности, а не по роду занятий или месту. В дворянских родословных книгах она не значится — это фамилия городского сословия или духовенства, без привязки к землевладельцам.