Фамилия Ксотенко — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Первое, что бросается в глаза, — это основа «Ксот-», которая не встречается ни в древнерусских именах, ни в распространённых прозвищах, ни в словарях тюркских или финно-угорских заимствований. Скорее всего, перед нами результат фонетической трансформации: фамилия могла возникнуть из более привычного варианта через замену или утрату звука.

Самый вероятный путь — от фамилии Хотенко. В украинской и южнорусской традиции фамилии на -енко образуются от имён и прозвищ: Хотенко — от Хотен (древнерусское имя Хотен, известное по былинам, или от глагола «хотеть» в значении «желанный»). При переходе в другую языковую среду или при записи в документах «х» могло замениться на «кс» (под влиянием греческого или церковнославянского произношения, где «х» иногда передавали как «кс»). Либо произошло упрощение: изначально фамилия звучала как Ксохотенко или Ксенофонтенко (от редкого крестильного имени Ксенофонт — «чужеголосый», «странный голос»), но в быту сократилась до Ксотенко.

Менее правдоподобная, но возможная версия — связь с греческой приставкой «ксо-» (от «ксонон» — «чужой, странный»). В этом случае прозвище Ксот могло означать «чужеземец», «нездешний». Однако для славянской фамильной модели такое прямое заимствование из греческого в качестве основы — большая редкость, обычно греческие корни проходили через имя (Ксенофонт) или прозвище.

Суффикс -енко — классический украинский и южнорусский патронимический формант, означающий «сын», «потомок». То есть носитель фамилии Ксотенко — потомок человека по прозвищу или имени Ксот (или его исходного варианта). Географически фамилия тяготеет к Украине, особенно к её центральным и восточным областям, где суффикс -енко наиболее распространён. В дореволюционных переписях она не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении или малой численности рода.

Таким образом, если вы ищете свои корни, стоит начать с проверки варианта Хотенко: возможно, при переезде или смене паспорта в XX веке букву «х» заменили на «кс» из-за ошибки писаря или желания придать фамилии «благородное» звучание.