Фамилия Ктидов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корень, нужно отбросить привычную модель «от имени или профессии + -ов» и присмотреться к греческому пласту русских фамилий.

В основе лежит слово «ктитор» (от греч. κτήτωρ — основатель, строитель, владелец, попечитель). В церковной и исторической лексике ктитором называли человека, который на свои средства построил или содержал храм, монастырь, а также жертвовал на иконы и утварь. Это не духовное лицо, а светский благотворитель, часто купец или боярин. Фамилия Ктидов образована по модели «ктитор → Ктид → Ктидов»: сначала от полного титула отсекли концовку (как в парах «Филарет — Филатов», «Магистр — Магидов»), затем добавили русский патронимический суффикс -ов.

Такое происхождение указывает на социальный контекст: предок носителя фамилии, скорее всего, не был священником, но имел отношение к церковному строительству или жертвовательству. Фамилия могла закрепиться за человеком, который служил при храме в качестве попечителя или старосты, либо за тем, кто получил прозвище «Ктитор» за щедрость. В бытовой речи греческое «ктитор» могло упроститься до «ктид» — отсюда и форма Ктидов, а не Ктиторов.

Встречается фамилия преимущественно в среде потомков греческого духовенства и купечества, переселявшихся в Россию в XVII–XIX веках, а также среди русского населения южных губерний, где было сильно греческое влияние. В отличие от фамилий на -ский или -ин, Ктидов — редкий пример, где греческое книжное слово стало основой для русского отчества. Других убедительных версий (от тюркских или славянских корней) нет: звукосочетание «ктид» нехарактерно для восточнославянской лексики.