Фамилия Кукота — редкий образец «профессионального» прозвища, застывшего в краткой форме. В основе, скорее всего, лежит диалектное слово «кукотка». В тверских говорах так называли кудель — вычесанный и перевязанный пучок льна или пеньки, приготовленный для пряжи. Человек, получивший прозвище Кукота, по всей видимости, занимался изготовлением такой пряжи или имел к этому ремеслу прямое отношение.

Обратите внимание на суффиксальную модель. Фамилия образована без типичных русских суффиксов принадлежности (-ов, -ин, -ский). Это так называемая «патронимическая» или «прозвищная» форма в чистом виде: само прозвище Кукота стало фамилией, не меняя окончания. Такие фамилии характерны для украинской и белорусской ономастики, но встречаются и в южнорусских регионах. В отличие от фамилий Кукотин или Кукоткин, где суффикс указывает на прямого потомка («чей сын?»), форма Кукота могла означать самого мастера-прядильщика. Географическая привязка к тверским говорам не случайна: лён и льняное производство исторически были основой хозяйства Тверской губернии, так что прозвище могло возникнуть именно в этой среде.