Фамилия Кукзенев — редкая и с неочевидной на первый взгляд основой. Её суть раскрывается, если отбросить суффикс -ев (вариант -ов после мягкой основы) и посмотреть на корень «Кукзен». В русском языке такого слова нет, зато есть фамилии Куксов, Кукса, Куклев, Кукин — все они восходят к прозвищу Кукса или Кук. «Кукса» в диалектах означало человека с неловкими руками, неумеху, иногда — плаксу или капризного ребёнка (от глагола «кукситься»). Но в фамилии Кукзенев мы видим необычный суффикс -ен-, который редко встречается в русских фамилиях напрямую.

Здесь, скорее всего, работает тюркская модель. Основа «кук» (в ряде тюркских языков — «небо», «голубой», «синий») плюс аффикс -зен, образующий прилагательное или имя. То есть Кукзен могло быть личным именем или прозвищем со значением «небесный», «синеглазый» или «сын синего» (в переносном смысле — благородного происхождения). Такие имена были распространены среди татар, башкир, чувашей, а потом русифицировались через добавление -ев. Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью — регионам, где веками жили вместе русские и тюркские народы.

Есть и более прозаичная версия: Кукзенев могло возникнуть от названия населённого пункта вроде Кукзень, Кукзино (такие топонимы встречаются в Татарстане и Чувашии). Тогда фамилия означала «выходец из Кукзеня». Но поскольку ни одна из версий не подтверждена документально в открытых источниках, обе остаются рабочими гипотезами. Сословно носители фамилии, судя по редким упоминаниям в метрических книгах XIX века, были преимущественно государственными крестьянами или мещанами — то есть людьми недворянского происхождения.

Таким образом, Кукзенев — яркий пример фамилии на стыке языков и культур, где тюркское имя или прозвище получило русский фамильный суффикс. Точно сказать, что означало исходное слово, сегодня трудно, но «небесный» или «синеватый» — самое правдоподобное толкование.