Фамилия Кульсундук — редкий пример, где тюркская модель словообразования наложилась на арабское имя. В основе лежит имя Кульсун, которое большинство исследователей считает фонетическим вариантом арабского Кульсум (или Кальсум). В арабском мире это имя знают по дочери пророка Мухаммеда — Фатиме, которую также называли Кульсум. Однако в тюркской среде имя Кульсун нередко давали и мужчинам, поэтому связывать фамилию исключительно с «материнской линией» (когда женщина становилась главой семьи) стоит с оговоркой: это лишь одна из возможных ситуаций, а не обязательное правило.

Фамилию образовали по характерной для тюркских языков модели: к основе Кульсун добавили суффикс -дук (встречается также в формах -дык, -тук, -тык). Этот суффикс в ономастике выполнял роль притяжательного или относительного показателя, превращая личное имя в родовое прозвище. Буквально Кульсундук можно понять как «принадлежащий Кульсуну» или «из рода Кульсуна». Такие фамилии на -дук/-дык особенно распространены у башкир, татар и казахов, что указывает на вероятный регион происхождения — Поволжье, Приуралье или северный Казахстан.

Существует и альтернативная версия. Она менее вероятна, но заслуживает упоминания: Кульсундук могли воспринять как стяжение от тюркского имени Кульсадык, где первая часть «кул» означает «раб божий» или «слуга», а вторая — арабское Садык («верный друг», «правдивый»). Но эта гипотеза слабее, потому что переход «Кульсадык → Кульсундук» требует неочевидных фонетических изменений (замена «а» на «у» и появление носового «н»), в то время как вариант от самостоятельного имени Кульсун объясняет форму напрямую.

Что касается сословной принадлежности: фамилии на -дук обычно не указывают на дворянство. Их носителями были крестьяне, ремесленники, воины — то есть основная масса тюркского населения, у которого родовые прозвища закреплялись в быту, а не через официальные реестры.