Фамилия Купиковский — редкий пример, где прозрачная, на первый взгляд, основа оказывается не такой однозначной. Словообразовательная модель ясна: суффикс -ский указывает на польское или западнорусское происхождение, а также на дворянский или шляхетский характер фамилии. Такие фамилии часто образовывались от названий местностей. Вопрос в том, что легло в основу — топоним или прозвище.

Самая прямая версия — географическая. Фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта вроде Купиково, Купиков или Купиковичи. Такие топонимы встречаются в Беларуси и на западе России, особенно в Смоленской и Брянской областях. В этом случае предок носителя фамилии был либо владельцем такого села (шляхтич, помещик), либо выходцем оттуда — крестьянином или мещанином, получившим фамилию по месту прежнего жительства. Модель «название села + -ский» — классическая для польской и украинской ономастики.

Однако корень «купик» или «купа» даёт и другую, более редкую возможность. В старых русских говорах «купик» — уменьшительное от «куп» (куча, груда, холм) или от «купа» (группа, толпа). Человек мог получить прозвище Купик за коренастое сложение, за привычку жить скученно или, напротив, за любовь к уединению на холмистой местности. В этом случае фамилия Купиковский — патронимическая или прозвищная, образованная через притяжательное прилагательное: Купик → Купиков → Купиковский. Суффикс -ский здесь «облагораживал» простое прозвище, что часто делали при выдаче документов в XIX веке, особенно среди духовенства и мещан.

Третья, менее вероятная версия связывает фамилию с торговлей. «Купик» могло быть ироничным прозвищем человека, который постоянно что-то покупает, или, наоборот, мелкого торговца. Но для такой основы логичнее была бы фамилия Купцов или Купин, а не Купиковский, так что эта гипотеза слабее остальных.

В любом случае, фамилия Купиковский — не массовая, а штучная. Её носители, скорее всего, происходят из узкого ареала, где закрепилось либо название деревни, либо конкретное семейное прозвище. Встретить её можно преимущественно в западных областях России, в Беларуси и среди потомков переселенцев из этих земель.