Фамилия Купикова — женская форма от Купиков, и её происхождение напрямую связано с неканоническим прозвищем или мирским именем Купик. В русской ономастике суффикс -ик нередко указывал на уменьшительно-ласкательную форму или на принадлежность к чему-то небольшому, а сама основа «куп» имеет два основных значения.

Первая, наиболее вероятная версия — связь с глаголом «купить». Прозвище Купик могли дать человеку, который занимался куплей-продажей, торговал на рынке или просто был прижимистым, «всё купить норовил». В этом случае фамилия относится к группе «профессиональных» прозвищ, распространённых в среде посадских людей и крестьян, которые подрабатывали мелкой торговлей. Вторая версия — происхождение от слова «купа» (груда, куча) или «купина» (куст, группа деревьев). В таком случае Купиком могли прозвать человека коренастого, плотного телосложения либо того, кто жил у заросшего кустарником места. Эта гипотеза слабее, так как форма «Купик» в значении «куст» почти не встречается в исторических документах, в отличие от однокоренных «Купин» или «Купинский».

Географически фамилия Купиков (и Купикова) тяготеет к северным и центральным регионам России — Архангельской, Вологодской, Костромской областям. Именно там в XVII–XVIII веках фиксируются крестьяне и посадские люди с прозвищем Купик. В южных губерниях фамилия редка.

Словообразовательная модель проста: основа Купик- + патронимический суффикс -ов, что буквально означает «сын Купика». Ударение в фамилии обычно падает на второй слог — Купико́ва, хотя в некоторых говорах возможен вариант с ударением на первый слог (Ку́пикова), но он менее типичен для литературной нормы. В отличие от фамилий на -ев (Купичев), суффикс -ов указывает на более древнюю модель образования от прозвища, а не от имени на -ий.

Таким образом, предок современных Купиковых, скорее всего, был связан с торговлей или получил прозвище за привычку покупать. Фамилия недворянская, исконно крестьянская или мещанская, что подтверждается её отсутствием в родословных книгах высшего сословия.