Фамилия Кушерницан — одна из тех, что сразу выдают южное, скорее всего молдавское или румынское происхождение. Её выдают суффикс и окончание. Если бы фамилия была русской, она оканчивалась бы на -ов или -ин, но здесь мы видим характерный для восточнороманских языков формант -ан. В румынской и молдавской ономастике суффикс -ан (-eanu) часто указывает на принадлежность к местности или роду занятий, а также может быть просто патронимическим (сын такого-то). В фамилии Кушерницан основа — «кушер» или «кушерник».

Корень «кушер» (coșer) в молдавском языке означает «плетёная корзина» или «лукошко». Соответственно, «кушерник» — это корзинщик, мастер, плетущий корзины. Это типичное ремесленное прозвище, которое закрепилось за человеком, а затем перешло к его потомкам. Фамилия Кушерницан, таким образом, буквально означает «сын корзинщика» или «потомок того, кто делал корзины». Встречаются и родственные формы — Кушер, Кушерник, Кошерник, Кошеру, что подтверждает единую ремесленную основу.

Географически фамилия тяготеет к Бессарабии и исторической Молдавии. В современной России она редка и встречается в основном среди потомков переселенцев с юга, особенно в Краснодарском крае и Ростовской области, куда в XIX–XX веках активно переселялись молдавские крестьяне. В самой Молдове фамилия Кушерницан также не является массовой, но её носители встречаются в центральных и северных районах.

Стоит отметить, что написание фамилии через «е» (Кешерницан) или с ударением на последний слог (Кушерницан) — вопрос местных диалектных особенностей. Ударение, скорее всего, падает на последний слог, как это свойственно многим румынским фамилиям. Никакой другой, более сложной или знатной этимологии у фамилии нет: перед нами чистое ремесленное прозвище, которое закрепилось за родом.