Фамилия Кутуев образована от тюркского мужского имени Кутуй (диалектный вариант — Кутай). В переводе с тюркских языков это имя означает «счастливый человек». Называя ребенка Кутуем, родители желали ему удачи и благополучия на всю жизнь. Потомок человека с таким именем со временем получал фамилию Кутуев.

Фамилия Кутуев — самобытный памятник восточной культуры. Её основа — личное имя, а не прозвище или ремесло, что характерно для многих русских фамилий тюркского происхождения. Модель образования проста: к основе имени Кутуй добавили русский патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — Кутуев). Такая схема была распространена в XVI–XVII веках, когда нерусское население Поволжья и Приуралья активно входило в состав Российского государства и получало фамилии по отцу.

Среди известных носителей — татарский писатель Адельша Нурмухамедович Кутуев (1903–1945), публиковавшийся под псевдонимом Адель Кутуй. Его творчество связано с татарской литературой первой половины XX века. Это не единичный случай: фамилия встречается у татар, башкир и других тюркоязычных народов, а также у русских, в чьих родословных были предки-тюрки.

Окончательно говорить о точном времени и месте происхождения конкретной ветви Кутуевых можно лишь на основании серьёзных генеалогических изысканий. Процесс формирования фамилии мог быть длительным и не всегда привязан к одной местности. Но ядро ясно: фамилия Кутуев восходит к древнему тюркскому имени со значением «счастливый».