Фамилия Куйсарин редкая и звучит не по-русски. Её основа и суффикс указывают на тюркское происхождение, скорее всего, казахское или башкирское. Разберёмся по порядку.

Корень «куйсар» или «куйсары» — это сложное слово. Первая часть «куй» в тюркских языках может означать «овца» (сравните с казахским «кой»). Вторая часть «сар» или «сары» переводится как «жёлтый» или «рыжий». Таким образом, «куйсары» — это «жёлтая овца» или «рыжая овца». В скотоводческих культурах прозвища по масти скота были обычным делом: так могли назвать человека за цвет волос (рыжеватый) или за то, что он пас отару рыжих овец. Впрочем, есть и другая версия: «куйсары» могло быть именем собственным или названием рода, где «куй» — это не животное, а часть личного имени (например, Куйбагар).

Суффикс «-ин» в данном случае не русский (как в фамилиях Пушкин или Ильин), а тюркский притяжательный аффикс, указывающий на принадлежность. Фамилия Куйсарин буквально означает «из рода Куйсары» или «принадлежащий Куйсары». Это типичная модель для казахских и башкирских фамилий, которые образовывались от имени предка. В русских документах XIX — начала XX века такие фамилии часто русифицировали, добавляя окончание «-ин» или «-ов», но по сути это прямая передача тюркской формы.

Географически фамилия тяготеет к южному Уралу и северному Казахстану. Встречается среди башкир и казахов, особенно в Оренбургской, Челябинской областях и в Западном Казахстане. Социальный контекст: предки носителя фамилии, скорее всего, были скотоводами-кочевниками, а прозвище закрепилось за целым родом или аулом. В отличие от многих русских фамилий, которые пошли от ремесла или отчества, здесь мы видим прямую связь с природой и хозяйством.

Написание — только с одной «с»: Куйсарин, не Куйсариин. Ударение, вероятно, падает на второй слог: КуйсАрин. Фамилия не имеет отношения к санскриту или арабскому языку, как иногда пытаются предположить в любительских генеалогиях. Это чисто тюркское прозвище по масти или родовой принадлежности.