Фамилия Куйсукин — редкая и нестандартная по звучанию для русского уха. Она почти наверняка тюркского происхождения, и её разбор стоит начать с географии: скорее всего, корни ведут в Поволжье, Приуралье или Западную Сибирь, где исторически жили башкиры, татары, казахи или ногайцы. В русской записи фамилия сохранила тюркскую основу и получила типичный русский суффикс принадлежности -ин, который в данном случае указывает на «сына» или «потомка» человека по прозвищу Куйсука.

Основа фамилии — «Куйсук» — скорее всего, сложное слово. Первая часть «куй» в тюркских языках может означать «песок», «пустыня» или «овца» (в зависимости от диалекта). Вторая часть «сук» — часто встречающийся компонент в личных именах и прозвищах, означающий «вода», «река». Таким образом, Куйсук могло быть прозвищем человека, жившего у «песчаной реки» или «реки в пустыне». Есть и другая версия: «куй» иногда переводят как «лей», «наливай», что делает прозвище «Куйсук» буквально «лей воду» — такое имя мог получить работник, занятый поливом или водоснабжением, либо просто человек, который любил много пить.

Модель образования фамилии проста: к тюркскому прозвищу Куйсук добавили русский патронимический суффикс -ин. По правилам русской грамматики, фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а, -я или согласный, но в случае с заимствованными именами суффикс мог присоединяться напрямую. Встречаются и однокоренные варианты — Куйсуков, где использован суффикс -ов, что говорит о возможной путанице при записи фамилии в метриках или переписях.

Сословно носители фамилии Куйсукин, вероятнее всего, относились к государственным крестьянам или казакам. В документах XIX века подобные фамилии встречаются среди тептярей и башкир Уфимской и Оренбургской губерний. Фамилия не получила широкого распространения и осталась локальной, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если ваш предок Куйсукин, ищите его в метрических книгах деревень вдоль рек Белой, Урала или Иртыша.