Фамилия Куйсунов — редкий случай, когда корень просматривается почти прозрачно, но точное значение ускользает. Основа здесь — «куйсун» или «куйсун», и самый прямой путь ведёт к тюркским языкам. В них «куй» часто означает «заливай», «лей», а «сун» — глагольный формант повелительного наклонения. Вместе это могло звучать как команда или прозвище: «Наливай!» или «Лей, пока не скажу хватит». Однако такая бытовая версия — лишь первый слой.

Более убедительная гипотеза отсылает к диалектному слову «куйсун» — так в некоторых тюркских говорах называли глиняный кувшин для воды или масла, иногда с узким горлом. Человек мог получить прозвище Куйсун по сходству с таким сосудом (например, за невысокий рост и плотное телосложение) или по профессии: предок мог быть гончаром, который делал именно эту посуду, либо торговал ею. Суффикс -ов в фамилии указывает на стандартную русскую патронимическую модель XIX века: «чей?» — Куйсунов, то есть сын или потомок Куйсуна.

Географически фамилия почти не встречается за пределами регионов с сильным тюркским субстратом — Дагестан, Чечня, отчасти Астраханская область и Ставрополье. Учитывая, что в этих местах фамилии на -ов активно давали при переписях и паспортизации в 1920–1930-е годы, Куйсунов могла возникнуть позже многих русских фамилий — как фиксация уличного прозвища, которое до того передавалось устно.

Интересная деталь: написание «Куйсунов» не единственный вариант. В старых записях можно встретить «Куйсуннов» с удвоенной «н» (от прозвища Куйсунна) или «Куйсунян» — если носители армянизировали фамилию при переселении. Но современная форма прижилась именно с одной «н», что говорит о её русификации по самому ходовому образцу.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Куйсунов стоит в одном ряду с Куйбышевым (от «куй баш» — «куй голову», то есть упрямец) или Куймановым (от «куйман» — «не трогай»). Но в отличие от них, куйсуновская основа не имеет явного отрицательного или грубого оттенка — скорее бытовой или ремесленный.