Фамилия Кужагалиева — это родовое имя тюркского происхождения, которое образовалось от личного имени Кужагали, а оно, в свою очередь, сложено из двух корней. Первый корень — «кужа» — это фонетическая переработка персидского имени Ходжа, то есть «господин, хозяин, наставник». Второй корень — «гали» — восходит к арабскому прилагательному со значением «великий, наивысший, дорогой, мощный». Вместе имя Кужагали можно перевести как «высокопоставленный хозяин» или «сильный господин». Скорее всего, родители давали такое имя сыну с пожеланием высокого общественного положения и уважения.

Фамилия построена по русской модели: к основе Кужагали- добавлен типичный для славянских фамилий женский суффикс -ева, указывающий на принадлежность (в данном случае — «дочь или жена Кужагали»). Мужской вариант фамилии — Кужагалиев. Если смотреть шире, то в самом имени Кужагали прослеживается тюркский способ словообразования, где -оглы (сын, потомок) могло бы быть окончанием, но в русской записи оно опущено или заменено на -ов/-ев.

Фамилия эта редкая и встречается преимущественно у народов, испытавших влияние ислама и тюркских языков, — у казахов, татар, башкир. Географически она привязана к регионам, где распространены мусульманские имена арабо-персидского круга. В отличие от множества фамилий на -ов, которые произошли от просторечных или прозвищных форм, Кужагалиева сохранила почти без изменений книжное, уважительное имя, что указывает на определенный социальный статус предка — возможно, это был религиозный деятель, зажиточный хозяин или человек, пользовавшийся авторитетом в общине.

Таким образом, фамилия Кужагалиева — это прямой отпечаток восточной антропонимической традиции, где имя несло не просто идентификацию, а программу на жизнь, и эта программа через века перешла в фамилию.