Фамилия Квиквиниа — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели образования русских фамилий: в ней нет славянских суффиксов -ов, -ин, -ский, а основа звучит нехарактерно для восточнославянского уха. С высокой вероятностью это фамилия грузинского происхождения, адаптированная русским языком.

В грузинском языке фамилии часто образуются с помощью патронимических суффиксов -дзе, -швили, -иа (или -иани). Окончание -иа (Квиквиниа) типично для западной Грузии, особенно для Мегрелии. Основа «Квиквин-» может восходить к грузинскому слову «квикви» (ქვიქვი) — звукоподражательному или уменьшительно-ласкательному, связанному с чем-то мелким, быстрым или звенящим. В некоторых диалектах «квикви» означает «огонёк» или «искра», что могло стать прозвищем живого, подвижного человека. Также есть версия, что это вариант имени Квирике (Квирика) — грузинской формы имени Кириак.

В русских документах фамилия могла записываться по-разному: Квиквиния, Квиквина, но форма на «-иа» — самая точная, сохраняющая грузинский корень. Встретить Квиквиниа можно в основном среди потомков грузинских дворян или крестьян, переселившихся в Россию в XIX–XX веках. В Грузии фамилия встречается, но не массово; она скорее локальная, привязанная к определённому роду из Мегрелии или Имеретии.

Таким образом, Квиквиниа — не русская фамилия, а грузинская, перешедшая в русский обиход. Её носители — потомки людей, которых в Грузии прозвали «искоркой» или «быстрым», а в России переписчики зафиксировали это прозвище в непривычной для славянского уха форме.