Фамилия Ларюточкин — редкий образец «матрёшечного» словообразования, где за каждым суффиксом скрывается предыдущая ступень уменьшения. В основе лежит имя Ларион (каноническая форма Иларион, от греческого hilaros — «весёлый, радостный»). В народной речи имя прошло через цепочку сокращений: Ларион → Ларя → уменьшительно-ласкательное Ларюта (с суффиксом -ют-, придающим оттенок нежности). Затем к прозвищу Ларюта добавился патронимический суффикс -очк-, который в русских фамилиях встречается редко. Обычно -очк- характерен для украинских и белорусских фамилий (Ковалёчек, Иваночко), а в русской традиции он выполняет двойную функцию: усиливает уменьшительность и указывает на прямую связь с отцом. Финальный суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Ларюточкин, то есть сын или потомок Ларюточки.

Исходная форма — Ларюточка — могла быть не просто прозвищем, а внутрисемейным именем для младшего сына или внука, которого звали по деду Ларюте. Такая трёхступенчатая модель (Ларион → Ларюта → Ларюточка → Ларюточкин) встречается в фамилиях вроде Иваночкин, Петровичкин, но Ларюточкин — более редкий вариант, поскольку имя Ларион в крестьянской среде было менее популярно, чем Иван или Пётр.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и поволжским говорам, где аканье и замена начального «и» на «а» (Иларион → Ларион) были нормой. Встречается в старых переписях Курской, Тамбовской и Саратовской губерний. Носители фамилии — скорее всего, потомки однодворцев или государственных крестьян, у которых фамилии закрепились позже, чем у дворян, но раньше, чем у бывших помещичьих крестьян. Сословная принадлежность невысокая: ремесленники, мелкие торговцы, церковнослужители.

Есть и менее вероятная версия: связь с диалектным словом «ларюта» — так в некоторых говорах называли болтливого человека (от «лары» — пустые разговоры). Но она уступает основной, потому что цепочка от имени Ларион прослеживается чётко, а диалектное значение не зафиксировано в авторитетных словарях русских говоров.