Фамилия Лидниченко — характерный пример южнорусской и украинской модели фамилий на -енко. Суффикс -енко в XVI–XVII веках был основным способом образования фамилий в Поднепровье, Слобожанщине и на юге России. Первоначально он означал «сын» или «потомок» (как польское -ич), позже закрепился как семейное имя. Лидниченко — значит «сын Лидника» или «потомок Лидниченка», где корень — прозвище или профессиональное имя Лидник.

С корнем сложнее. В украинском языке есть слово «лід» — лёд. Лидником могли называть человека, который торговал льдом, заготавливал его для ледников (погребов) или возил лёд. В южных регионах, где лёд был товаром (особенно до эпохи холодильников), такая профессия была востребована. Однако распространённая фамилия Ледник (и её варианты) чаще указывает именно на это занятие. Не исключено, что Лидниченко — фонетический вариант от «Ледниченко»: в южных и восточных говорах «е» после мягких согласных могло переходить в «и» (ср. «лид» вместо «лед»).

Вторая версия — от имени Лидня (редкое уменьшительное от Владимир, Мефодий или производное от «лид» в значении «человек» в некоторых диалектах). Но она менее убедительна: в украинской антропонимии прозвища по ремеслу давали фамилии чаще, чем уменьшительные имена с таким редким корнем.

Фамилия преимущественно встречается в центральных и восточных областях Украины (Полтавщина, Черкащина, Сумщина), а также в южных регионах России, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках. В дореволюционных метрических книгах Лидниченко — в основном крестьяне и мещане, без дворянских корней. Это типичная «народная» фамилия, образованная от бытового прозвища, а не от церковного имени.