Фамилия Ликаченков — один из тех случаев, когда внешне ясная форма таит в себе загадку на уровне корня. На первый взгляд, перед нами типичная русская фамилия с патронимическим суффиксом -ов, образованная от прозвища или имени Ликач, Ликаченок. Но что стоит за этим «Ликач»? Самое прямое объяснение — связь с глаголом «ликовать»: Ликачом могли прозвать человека жизнерадостного, шумного, склонного к веселью. Однако в русских говорах слово «ликач» имело и другие, менее очевидные значения. В некоторых диалектах так называли человека с бледным, худым лицом (от «лико» — лицо, облик), а в псковских и тверских говорах — даже нечистую силу, лешего или домового.

Вторая версия, более прозаическая, но не менее вероятная, отсылает к церковному имени. В основе может лежать каноническое имя Гликерий (от греческого «гликюс» — сладкий), которое в народной речи сокращалось до Ликеря, Ликаня, а затем и до Ликач. В таком случае Ликаченков — это «внук» или «сын» человека по имени Ликач, которое было уменьшительной формой от Гликерия. Подобные цепочки превращений (Евдоким — Дока — Докачев, Гликерий — Ликач — Ликачев) хорошо известны русской ономастике.

Суффикс -енков, характерный для восточноукраинских и южнорусских земель, указывает на географию происхождения. Фамилии на -енко и -енков традиционны для Слобожанщины, Курской, Воронежской, Ростовской областей. Если бы предок остался на Украине, фамилия звучала бы как Ликаченко, но при переходе в великорусскую среду фамилию «обрусили», добавив окончание -ов. Таким образом, корни Ликаченковых, скорее всего, уходят в украинское пограничье, где в XVII–XVIII веках оседали выходцы из Речи Посполитой и запорожские казаки.

Встречается также вариант написания с одной «к» — Ликаченов, но он гораздо реже. Сдвоенная «к» в фамилии Ликаченков — результат морфологического сращения: основа Ликач (с конечным «ч») и суффикс -енк- дают на стыке звук [ч], который на письме передаётся как «ч», а вторая «к» принадлежит уже суффиксу -ов. Фамилия не относится к числу распространённых, её носители рассеяны по России, но чаще всего встречаются в Центральном Черноземье и Поволжье.