Фамилия Лимбахоо — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, но при этом ничего не говорит о происхождении носителю русского языка. Она не вписывается в привычные модели русских фамилий: в ней нет суффиксов -ов, -ин, -ский. Двойное «оо» на конце — главная подсказка. В русской ономастике такое окончание — почти стопроцентный маркер эстонского или финского происхождения. В эстонском языке двойные гласные — норма, они передают долготу звука.

Если разобрать фамилию по частям, основа «Лимба» может восходить к эстонскому слову «limb» — «конечность», «член тела». Вторая часть «хоо» — это эстонское «hoo» (родительный падеж от «hoog» — «размах», «темп», «инерция»). Буквально Лимбахоо можно перевести как «размах конечности» или «инерция ноги». Скорее всего, это прозвище, которое дали человеку за характерную походку, широкий шаг или манеру двигаться. В эстонской традиции такие прозвища часто закреплялись за крестьянами и становились фамилиями после реформы XIX века.

Есть и другая, менее вероятная версия. «Лимба» может быть искажением немецкого «Linde» (липа) или «Limburg» (историческая область в Бельгии и Нидерландах). Но для эстонского языка такое заимствование нетипично. К тому же, фамилия пишется через «х», а не через «г», что указывает на исконно эстонское произношение, где «h» — обычный звук.

В любом случае, фамилия Лимбахоо — не русская и не славянская. Её носители — почти наверняка потомки эстонских крестьян, переселившихся в Российскую империю или оставшихся в Прибалтике. Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Лимбахо́о, как это свойственно эстонскому языку. Других версий, подкреплённых данными, у этой фамилии нет.