Фамилия Липикина — женская форма фамилии Липикин. В основе её лежит прозвище или нецерковное имя Липика, которое, скорее всего, восходит к слову «липкий». В старину так могли назвать человека, который постоянно приставал с разговорами или делами, был навязчивым — «прилипала». В словаре Владимира Даля «липкий» означает и то, что легко пристаёт, и переносно — «докука, неотвязный человек». Вполне вероятно, что предок Липикиных получил такое прозвище за характер.

Модель образования фамилии проста и типична для русского севера и центральных областей: суффикс -ин указывает на принадлежность к отцу или главе семьи. Липикин — сын Липики, то есть «чей?» — Липикин. Формант -ин, а не -ов, часто встречается у фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а, -я. Это нередко говорит о том, что прозвище было в ходу в устной речи, а не в официальных документах, где чаще писали по отчеству.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с названием дерева — липа. В таком случае Липика могло быть уменьшительно-ласкательным прозвищем человека, жившего у липовой рощи или занимавшегося липовым лыком. Однако слово «липа» даёт основу «лип-», а суффикс -ик- в прозвище Липика больше характерен для личных имён (как Мишка, Гришка) или для указания на свойство («липкий»). Поэтому версия с «липким» выглядит убедительнее.

Фамилия Липикина не относится к числу распространённых дворянских или купеческих родов. Скорее всего, её носители — выходцы из крестьянской или мещанской среды. Встречается она преимущественно в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской и Архангельской областях, где суффикс -ин в фамилиях особенно типичен. Там же сохранились и однокоренные фамилии — Липин, Липинский, Липкин, но Липикин стоит особняком из-за редкого суффикса -ик- в основе, который делает фамилию более «разговорной» и конкретной.