Фамилия Липияткин — один из тех случаев, где с первого взгляда ясна основа, но неочевидна её природа. Корень здесь — «Лип-», указывающий либо на липу (дерево, древесину, цвет), либо на липкость, что в прозвищах могло означать человека назойливого или, наоборот, того, кто «прилипает» к делу. Однако ключ к разгадке — в суффиксальной цепочке.

Самое интересное в фамилии — формант «-яткин». Он редок и нестандартен. Чаще встречается суффикс «-кин» (от имён на -а, -я) или «-яткин» как вариант отчества от уменьшительного имени с суффиксом «-ятка». Например, в русских говорах бытовали личные имена Липятка или Липятко — гипокористические формы от Лип (сокращение от Филипп) или от прозвища Липа. Схема образования проста: Липятка → Липяткин сын → Липияткин (с «выпадением» гласного в беглом произношении, что нормально для живой речи: Липяткин, а на письме — под влиянием аканья или диалектного произношения — Липияткин).

Таким образом, предок носителя этой фамилии, скорее всего, звался Липятка (или Липятко). Это мог быть сын Филиппа (в народной форме Липа) или человека по прозвищу Липа — либо плотника, работавшего с липой, либо того, кто «облипал» вокруг начальства. Версия с деревом более правдоподобна: липа — ценный поделочный материал, и прозвища по роду занятий (Липник, Липов) были распространены. Однако форма на «-ятка» — уменьшительная, почти ласкательная, что говорит о том, что прозвище могло даваться не взрослому мастеру, а скорее парню или подростку, например, «Липятка» — подмастерье липодела.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным русским областям, где липа была обычным деревом и где живы суффиксы «-ятк-» в личных именах. Встречаются варианты написания — Липяткин, Липеяткин — но «Липияткин» с «и» в первом слоге — результат исторического аканья: произносили [лип’а́тк’ин], а записывали на слух. Это не ошибка, а живая черта русской ономастики.