Фамилия Лисконоженко — редкий пример украинской фамилии, в основе которой лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, построенное на контрасте или иронии. Суффикс -енко однозначно указывает на украинское происхождение и патронимическую модель: так называли сына или потомка человека, носившего прозвище Лисконог. Форма «Лисконоженко» — результат чередования г/ж, характерного для украинского языка при образовании фамилий (ср. Нога — Ноженко).

Самая сложная и интересная часть — корень. Первая часть, «лиско-», скорее всего, восходит к украинскому слову «лиско» — блеск, лоск, глянец, или к прилагательному «лискучий» (блестящий, гладкий). В диалектах «лисний» означало «глянцевый», «лоснящийся». Вторая часть, «-ног», — это «нога». Вместе «Лисконог» могло быть прозвищем человека с необычными ногами: либо с очень гладкой, блестящей кожей на ногах (что в крестьянском быту было редкостью), либо, наоборот, с ногами, которые «блестели» от грязи или мозолей. Есть и более прозаичная версия: прозвище могли дать тому, кто быстро и легко бегал — «ноги блестят» от скорости.

Менее вероятна, но возможна связь со словом «лис» (хищник). Если основа «лиско-» — это диалектный вариант от «лис», то «Лисконог» могло означать «лисья нога» — прозвище хитрого, изворотливого человека, который «след заметает». Однако фонетически форма «Лисконоженко» тяготеет именно к «лиско» (блеск), а не к «лис», где ожидалось бы *Лисоноженко.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, где суффикс -енко наиболее распространен. Встречаемость фамилии крайне низкая, что говорит о её локальном происхождении — возможно, от одного родоначальника в конкретном селе. В исторических документах фамилия не зафиксирована в массовом порядке, поэтому восстановить точную профессию или сословие предков сложно. Скорее всего, это были свободные крестьяне или казаки, получившие прозвище по внешней или поведенческой особенности.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Лиско, Лисконог, Лисков) показывает, что корень «лиск-» в украинской ономастике чаще связан именно с блеском и гладкостью, а не с животным миром. Таким образом, Лисконоженко — это потомок человека, которого в округе называли «Блестящая нога»: то ли за опрятность и чистоту, то ли за быстроту, то ли за какую-то иную броскую деталь, связанную с ногами.