Фамилия Лисцын — редкий случай, где привычное ухо подсказывает неверную основу. На первый взгляд кажется, что корень здесь «лис» (от животного), но на самом деле фамилия образована от прозвища или мирского имени Лисец. Это уменьшительная форма от «лис» с суффиксом -ец: Лисец — «маленький лис», «лисёнок». Такие имена в древности давали не столько за хитрость, сколько за внешность (рыжие волосы) или повадки. Фамилия строится по стандартной русской модели: к основе на -ец добавляется притяжательный суффикс -ын (в современном написании -ин). То есть Лисцын буквально означает «чей? — сын Лисеца». Ударение в фамилии почти всегда падает на первый слог: Ли́сцын.

Интересно, что написание с ц (а не «Лисин» от «лиса») — ключевая подсказка. Если бы предка звали просто Лис, фамилия была бы Лисов или Лисин. Суффикс -ец указывает на то, что прозвище было именно ласкательным или уменьшительным. В ономастике (например, в работах Б. Унбегауна) такие фамилии на -цын относят к группе, образованной от основ на -ец с последующим стяжением: Лисец → Лисцын (как Кузнец → Кузнецов, но с другим суффиксом). Вариант написания через «ы» — Лисцын, а не Лисецын — закрепился из-за беглой гласной «е» в корне: в косвенных падежах (кого? — Лисеца) «е» выпадала, и форма «Лисца» дала основу для фамилии.

По географии фамилия встречается крайне редко и не имеет массового очага. Можно предположить, что носители происходят из северных или центральных областей России, где были распространены прозвища с суффиксом -ец. Сословно фамилия не элитарная: скорее всего, это крестьянские или мещанские корни. Прозвище Лисец мог получить человек с рыжими волосами, хитроватый или просто невысокого роста (по аналогии с уменьшительными формами). В отличие от фамилии Лисицын (от «лисица»), Лисцын — более древняя по форме, без «зоологического» суффикса -иц-, что говорит о прямом прозвище, а не о вторичном образовании от названия самки.