Фамилия Лисюйко — яркий пример украинского фамильного типа на -юк (с вариантом -юйко). Такая модель характерна для Подолья и Волыни: суффикс -юк/-юйко в украинской ономастике образует патронимы, то есть фамилии по отцу. Если разобрать слово по косточкам, основа «Лис» восходит к прозвищу или имени Лис (от названия животного), а формант -юйко — это фонетический вариант суффикса -юк, возникший под влиянием местных говоров или просторечного произношения.

Прозвище Лис на Руси давали не только за рыжий цвет волос или хитрость. В старину слово «лис» могло означать «льстец», «угодник», а в некоторых диалектах — «обманщик». Однако в основе фамилии могло лежать и мирское имя Лис — дохристианское имя-оберег, которое давали ребенку, чтобы звериная хитрость или ловкость перешли к нему. Второй вариант: фамилия могла произойти от уменьшительной формы имени Елисей (в народе — Лисей, Лисюк). Тогда Лисюйко — это «внук или сын Лисюка», то есть потомок человека, которого звали Лисей.

Географически фамилия Лисюйко привязана к западу Украины — Винницкая, Хмельницкая, Житомирская области. В российских переписях она встречается редко, чаще в виде Лисюков. Вариант с -й- (Лисюйко) фиксирует живую устную традицию: в украинских говорах мягкий звук [к] после [у] иногда переходит в [йк] — так же, как из Грицюк делали Грицюйко. Это не ошибка письма, а диалектная особенность.

Сословно фамилия невысокая: носители Лисюйко в XIX веке — казаки, крестьяне, редко мещане. Дворянских родов с таким окончанием не зафиксировано. В современной Украине фамилия нечастотная, но стабильная — встречается в селах Подолья и в среде городских переселенцев из тех мест. Если сравнивать с однокоренными: Лисенко — более распространенный украинский вариант, Лисюк — польско-украинский, а Лисюйко — как раз та локальная форма, по которой можно угадать, откуда родом предки.