Фамилия Логоматис — редкий пример фамилии, которая почти наверняка не имеет славянского происхождения, несмотря на характерное окончание. В русском языке суффикс -ис не является типичным для образования фамилий (в отличие от -ов, -ин, -ский). Это окончание указывает на греческие корни. В греческой ономастике фамилии на -ис (или -идис) распространены и часто образованы от личных имён, профессий или прозвищ.

Основа «Логомат-» восходит к греческому слову «логос» (слово, речь, разум) и, вероятно, связано с глаголом «логотео» — говорить, рассуждать, или существительным «логотис» — счетовод, бухгалтер, человек, ведущий учёт. В Византийской империи существовала должность «логофет» — государственный секретарь или министр финансов. Таким образом, Логоматис — это патронимическая или профессиональная фамилия, которую могли дать потомкам человека, занимавшегося учётом, письмоводством или финансами.

С точки зрения словообразования, фамилия построена по модели «основа (логофет/логотис) + суффикс принадлежности -ис». В греческой традиции суффикс -ис (часто в форме -идис, -адис) означает «сын такого-то» или «происходящий от». То есть Логоматис — «сын логофета» или «потомок того, кто вёл счёт». Фамилия могла закрепиться за греческими переселенцами, оказавшимися на территории Российской империи (например, в Причерноморье, Крыму или Одессе) в XVIII–XIX веках.

В русском контексте носители фамилии Логоматис — это, скорее всего, потомки греческих колонистов или выходцев из балканских регионов, где греческое влияние было сильным. Фамилия не получила широкого распространения и остаётся локальной и редкой. Встречается в основном в южных регионах России и Украины, а также в среде греческой диаспоры. Иных версий (например, от славянского «ломать») у фамилии нет — они противоречат фонетике и типичным моделям русских фамилий.