Фамилия Лонишин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её по частям и вспомнить, как на Руси образовывали фамилии.

Основа фамилии — Лониш. Скорее всего, это вариант имени или прозвища. Наиболее вероятная версия ведет к каноническому имени Лонгин (от латинского longus — «длинный»). В народном произношении имя упрощалось: Лонгин превращался в Логин, а затем, через чередование согласных (г/к/ш), мог дать форму Лониш. Такое преобразование — не редкость: в русских говорах звук «г» перед «и» мог смягчаться и переходить в «ш» (сравните: нога — ножка). Таким образом, Лониш — это уменьшительная или обиходная форма имени Лонгин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность. В древнерусской модели фамилий на -ин означало «чей?» — сын Лониша, потомок Лониша. Поэтому Лонишин — это буквально «Лонишев сын» или «человек из рода Лониша». Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин широко распространены.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с прозвищем от диалектного слова «лоньша» или «лонись», что в некоторых говорах означало «в прошлом году», «недавно». Так могли прозвать человека, который родился или появился в селе не так давно, или же того, кто всё время откладывал дела «на лонись». Однако эта версия слабее: прозвища от наречий времени встречаются реже, чем производные от имён.

Географически фамилия Лонишин тяготеет к западным и северо-западным регионам бывшей Российской империи — встречается в Беларуси, на Смоленщине, в Псковской области. Это косвенно подтверждает связь с именем Лонгин, которое было популярно в православной среде именно в этих краях. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Если коротко: ваш предок по мужской линии, скорее всего, носил имя Лониш (производное от Лонгина), и фамилия закрепилась за его детьми как «Лонишины». Со временем окончание стало стандартным, и мы получили современную форму.