Фамилия Лопханова — женская форма фамилии Лопханов, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени. Самая вероятная основа — диалектное слово «лопхан» или «лопхун». В северных и сибирских говорах так могли называть неловкого, простоватого человека, ротозея. Есть и другая версия: в некоторых регионах «лопханом» называли большого неуклюжего медведя, и прозвище могло перейти на человека с похожей внешностью или повадками. Таким образом, фамилия скорее всего прозвищная, образованная от характеристики человека.

Словообразовательная модель типична для русского севера и востока. Суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность: «чей?» — Лопханов, то есть сын или потомок Лопхана. Окончание -а в женской форме — стандартное грамматическое изменение. Сама основа «лопх-» редкая, и фамилия встречается нечасто. Её география тяготеет к Архангельской области, Коми, а также к Зауралью — регионам, где сохранились архаичные говоры.

Интересно, что фамилия Лопханов не имеет отношения к тюркским или финно-угорским корням, хотя звучит по-северному необычно. В ономастических справочниках её не всегда упоминают, но в метрических книгах XIX века можно найти крестьян и мещан с этой фамилией в Вологодской и Вятской губерниях. Это подкрепляет версию о прозвище от местного диалекта.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Лопин, Лопатин, Лопандин — Лопханов стоит особняком из-за редкого суффикса -хан. В русских фамилиях этот элемент иногда заимствован из тюркских языков (хан как титул), но в данном случае он, скорее всего, является частью звукоподражательной или описательной основы, а не титулом. Правдоподобнее всего, что предок носителя фамилии получил прозвище за медлительность или нерасторопность, и оно закрепилось за родом.