Фамилия Лопотецкая — редкий пример, где географическое имя взяло верх над прозвищем. Перед нами типичная «географическая» фамилия, образованная суффиксом -ск- (в женском роде -ская), который в русской традиции указывал на связь с местностью. Основа здесь — топоним Лопотец или Лопотцы. Так могли называть небольшую речку, ручей, село или урочище. Корень «лопот-» в славянских говорах имеет звукоподражательную природу: «лопотать» значит говорить невнятно, быстро, бормотать, а также издавать плеск, шум воды. Речка Лопотец — это «говорящая», журчащая вода.

Поскольку фамилия оканчивается на -цкая (а не на -ская), это указывает на конкретную форму исходного названия: скорее всего, село или деревня называлась Лопотцы (множественное число). Такая модель типична для западнорусских и белорусских земель, где множество сел носили названия по рекам или характерным признакам местности. Вероятнее всего, предок носительницы фамилии получил её при переезде: переселился из деревни Лопотцы в другое место, и его записали как «Лопотецкий» — то есть выходец оттуда. Женская форма Лопотецкая закрепилась за дочерью или женой такого переселенца.

Менее вероятна, но возможна версия происхождения от прозвища Лопотец — болтливого, невнятно говорящего человека. В этом случае фамилия образовалась бы по той же модели (Лопотец → Лопотецкий), но встречается такой путь реже: прозвища чаще давали суффиксы -ов, -ин. Однако полностью исключать её нельзя: в псковских и новгородских говорах «лопотун» — говорун, и фамилия могла закрепиться за потомками такого человека.

Фамилия Лопотецкая — штучная, нечастотная. Её носительницы в основном встречаются на западе России и в Беларуси, что подтверждает географическую версию. По сословной принадлежности предки, скорее всего, были крестьянами или мещанами: дворянские фамилии на -ский чаще образовывались от названий имений (с ударением на окончание), а здесь ударение, судя по произношению, падает на корень — Лопоте́цкая, что типично для фамилий выходцев из деревень.