Фамилия Лугинец образована по модели, типичной для западнорусских, украинских и белорусских земель: основа плюс суффикс -ец. Этот суффикс в фамилиях обычно указывает на выходца из определённой местности — человека, который «откуда-то родом». Поэтому Лугинец — это тот, кто происходит из места с названием Лугино или Луга.

Деревни и сёла с названием Лугино встречаются в нескольких областях России, но самый известный и древний топоним, с которым связывают эту фамилию, — город Луга в Ленинградской области. Славянское поселение на реке Луга упоминается в летописях под 947 годом, а статус города Луга получила в 1777 году, при Екатерине Великой. В 1781 году она стала уездным городом. Если предки Лугинца были родом именно оттуда, то фамилия могла закрепиться за переселенцем из этих мест в другие регионы.

Сам топоним Луга восходит к нарицательному слову «луг» — «мелкотравная равнина; сенокосное, пастбищное угодье». Это прозрачная и правдоподобная версия, хотя не исключено, что в основе могло лежать личное прозвище Луг — так могли назвать человека, жившего у заливного луга или владевшего покосами.

Встречается и более редкая трактовка: суффикс -инец (от которого в разговорной речи осталось -ец) встречается в фамилиях, образованных от названий рек. В таком случае Лугинец — это человек, живший на реке Луге. Эта версия менее вероятна, но имеет право на существование, учитывая, что река Луга — крупная водная артерия региона.