Фамилия Лугиниа — редкий случай, когда написание подсказывает иноязычное происхождение. В русской ономастике фамилии, оканчивающиеся на -иа, почти не встречаются: стандартные русские фамилии имеют суффиксы -ов, -ев, -ин, -ский или, реже, -их/-ых. Окончание -иа характерно для грузинских, греческих, румынских или итальянизированных фамилий. Скорее всего, перед нами форма грузинской фамилии Лугинидзе или Лугиашвили, адаптированная при записи в русских документах: грузинский суффиксальный элемент -иа часто передаётся именно так. В грузинском языке суффикс -иа указывает на принадлежность или происхождение, то есть «Лугиниа» буквально означает «из рода Луги» или «относящийся к Луге».

Основа «Луг-» в этом случае, вероятно, восходит к личному имени или прозвищу. В грузинской антропонимии встречается мужское имя Лука (Луг- как сокращённая основа), но возможна и связь с грузинским словом «луги» (луг, поляна) — прозвищем человека, жившего у луга или владевшего им. Впрочем, для русского уха фамилия звучит так, словно образована от слова «луг», но с нетипичным суффиксом: если бы её создавали в русской среде, получилось бы Лугин или Лугов.

География фамилии подсказывает, что её носители — потомки выходцев с Кавказа или из греческих поселений Причерноморья. Встречаемость крайне низкая: в современных базах данных фамилия Лугиниа фиксируется единичными случаями, в основном на юге России и в Краснодарском крае. Это типичная «миграционная» фамилия, которая могла измениться при записи в метрических книгах или паспортах. Например, грузин Лугинидзе, переехав в русскую губернию, мог получить запись «Лугиниа» из-за того, что писарь отбросил окончание -дзе, оставив только грузинский суффикс -иа.

Таким образом, фамилия Лугиниа не имеет славянских корней, а её носители, скорее всего, потомки грузин или греков, чья фамилия была русифицирована в написании, но сохранила чужеродное для русского языка окончание. Это редкий пример того, как одна буква в суффиксе указывает на целую историю переселения и адаптации.