Фамилия Лупянникова — женская форма мужской фамилии Лупянников. Эта фамилия образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от прозвища или названия профессии с помощью суффикса -ник и родового окончания -ов/-ев. Сначала появилось прозвище Лупянник, которое закрепилось за человеком, а затем его потомки стали Лупянниковыми.

Корень фамилии — «луп-». В русских говорах глагол «лупить» имеет несколько значений: бить, колотить, а также сдирать кору, кожуру или шелуху. Прозвище Лупянник могли дать человеку вспыльчивому, драчливому, или же, наоборот, тому, кто занимался обработкой лыка, коры или лущения зерна. Вторая версия выглядит правдоподобнее: профессиональные прозвища на -ник (как Плотник, Бондарь, Скорняк) часто становились основой для фамилий. Лупянником могли называть того, кто драл лыко для лаптей или очищал лес от коры. Суффикс -ян- в основе указывает на принадлежность к действию или предмету, то есть Лупянник — это человек, связанный с луплением.

С точки зрения географии, фамилия Лупянников встречается в южнорусских и центральных регионах, а также в Зауралье, куда переселенцы приносили свои прозвища. Встречаются однокоренные фамилии Лупенко, Лупин, Лупяков, но модель с суффиксом -ник встречается реже, что делает Лупянниковых носителями более конкретного прозвищного имени.

Исторически фамилия не принадлежала к дворянским родам — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, которая фиксировалась в переписных книгах и ревизских сказках. В современном мире женская форма Лупянникова может указывать на то, что носительница происходит из семьи, где фамилия передавалась по мужской линии, и в документах закрепилась именно эта форма.