Фамилия Лысоконев — редкий образец русской фамилии, построенной на сложении двух корней. В отличие от более привычных одноосновных фамилий (Кузнецов, Попов), Лысоконев образована от прозвища, состоящего из двух слов: «лысый» и «конь». Такая модель — сложение прилагательного и существительного — в русской ономастике встречается нечасто. Можно вспомнить фамилии вроде Белокопытов, Долгоруков, но в них второй корень часто указывает на часть тела или качество. Здесь же — животное, что делает прозвище особенно образным.

Прозвище Лысый Конь могли дать человеку по нескольким причинам. Самая прямая — внешняя: владелец лысого (без гривы или с белым пятном на голове) коня, либо сам человек, напоминавший чем-то такое животное — например, лысый и долговязый. Вторая версия связана с ироническим народным юмором: «лысым конём» в некоторых говорах могли называть упрямого, необъезженного или, наоборот, слишком спокойного мужика. Третья, менее очевидная, — прозвище могло относиться к коню как к символу: лысый конь в крестьянской среде считался необычной, «нечистой» масти, и хозяин такого коня получал соответствующее прозвище.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Лысоконев — сын Лысоконя, то есть потомок того самого человека с прозвищем. Типичная для русских фамилий модель: прозвище на согласный дает суффикс -ов/-ев. Здесь окончание -ев, а не -ов, потому что основа оканчивается на мягкий согласный (конь). Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным регионам — там, где в говорах чаще встречались сложные прозвища. Встречается она крайне редко, в основном в Курской, Воронежской, Ростовской областях.

Сравнение с другими фамилиями подтверждает логику. Есть Лысенков (от Лысенко — украинская форма), Лысогоров (от «Лысая гора»). Лысоконев стоит особняком: в нём нет ни географической привязки (как в Лысогорове), ни уменьшительного суффикса (как в Лысенкове). Это чисто бытовое, «живое» прозвище, которое закрепилось за родом. О дворянском происхождении фамилии ничего не известно — скорее всего, предки Лысоконевых были крестьянами или однодворцами, людьми, чья жизнь была тесно связана с лошадью и землёй.