Фамилия Любинецкий в своей основе содержит указание на место, откуда родом её первый носитель. Чаще всего такую фамилию давали человеку, который переехал из села или деревни с названием Любино, Любинец или Любино Поле. На карте России и соседних стран таких топонимов несколько: это и болгарское село Любино, и деревня Любино Поле в Новгородской области, и село Любино-Малороссы в Омской области. Суффикс -ецкий типичен для польской, западнорусской и украинской традиции образования фамилий от географических названий: он указывал на принадлежность к местности («тот, кто из Любина»).

Существует и другая версия, хотя она менее вероятна для фамилии с таким окончанием. Согласно ей, в основе лежит не название села, а личное имя Люба — краткая форма от славянского имени Любава (со значением «любящая, любимая»). В этом случае фамилия образовалась бы от прозвища Любинец («сын или потомок Любы») с добавлением типичного суффикса -ский. Однако на практике модель «имя + -инецкий» встречается реже, чем топонимическая, поэтому основная гипотеза остаётся географической.

Сама фамилия — относительно редкая. Её носители встречаются в основном в западных областях России, в Беларуси и на Украине, что подтверждает связь с ареалом распространения фамилий на -ский/-цкий. Сословной привязки у Любинецких нет: так могли называть и крестьянина, переселившегося в другой уезд, и мещанина, записанного по месту прежнего жительства.