Фамилия Любятинская — редкий случай, когда её основа на слуху, но происхождение неочевидно. На первый взгляд корень «люб» наталкивает на мысль о прозвище «Любята» — ласковом человеке. Однако в русской ономастике такая модель встречается реже, чем топонимическая. Фамилия образована по типу польских, украинских и западнорусских дворянских фамилий на -ский/-цкий, которые обычно указывали на владение землёй или происхождение из определённого места.

Наиболее вероятная версия: предок носителя фамилии был помещиком или жителем населённого пункта с названием Любятин, Любятино или Любятичи. Такие топонимы действительно существуют: село Любятино есть в Псковской области, а деревни с похожими названиями встречаются в Беларуси и на западе России. Суффикс -ин- в основе указывает на принадлежность кому-то: Любятин — значит «поселение человека по имени Любята». Имя Любята — производное от славянского имени Люб (Любим) с уменьшительным суффиксам -ята, как Добрыня от Добр, или Гостята от Гость. В древнерусских берестяных грамотах встречается форма «Любята» как личное имя, означавшее «любимый, милый».

Менее вероятна, но возможна версия от прозвища, данного человеку за характер: «Любята» — тот, кто всех любит, ласковый, добродушный. В этом случае фамилия образовалась через отчество: сын Любяты стал Любятиным, а затем, при переходе в дворянское сословие или при переселении, к основе добавили фамильный суффикс -ский, типичный для шляхты и духовенства. Такая смена суффикса — не редкость: крестьянин Любятин мог стать Любятинским, получив землю или сан.

Сама фамилия — женского рода, мужской вариант — Любятинский. Встречается она крайне редко, в основном на западе России, в Беларуси и на Украине. В дореволюционных записях фамилия могла писаться через «о» — Люботянская, если корень путали с диалектным «любота» (красота, приятность). Но современное написание с «я» сохраняет прямую связь с древним именем Любята, которое сегодня почти вышло из употребления.