Фамилия Люгусев встречается нечасто, и её происхождение — не из тех, что лежат на поверхности. Скорее всего, в её основе лежит прозвище или мирское имя, образованное от прилагательного «люгусый». В русских говорах это слово имело конкретное значение: «кривой», «косой» на один глаз. Так могли прозвать человека с заметной особенностью внешности — не обязательно слепого, но, например, того, кто щурился или имел бельмо. Прозвища по физическим приметам были в ходу у всех сословий и легко переходили в фамилии, закрепляясь за потомками.

Суффикс -ев указывает на типичную русскую патронимическую модель: Люгус → Люгусев, то есть «сын Люгуса». Исходная форма имени или прозвища — Люгус — возникла из усечения прилагательного «люгусый». Встречается и вариант написания с буквой «и» — Люгусев, но по смыслу это одно и то же. Важно не путать эту фамилию с похожей по звучанию, но другой по корню фамилией Лугусев — та может быть связана с топонимом Луга или луговым ландшафтом.

Географически фамилия Люгусев тяготеет к северо-западным и центральным областям России, где диалектное слово «люгусый» было в обиходе. Встречается она в Псковской, Новгородской, Тверской и соседних губерниях. В дореволюционных переписях можно найти крестьян и мещан с этой фамилией — то есть она не была дворянской или купеческой, а бытовала в среде простых людей. Сословного барьера для такого прозвища не существовало: кривизна глаза не выбирала социального положения.

Редкость фамилии объясняется тем, что исходное слово «люгусый» со временем вышло из активного употребления, уступив место более общерусским «кривой» или «косой». Фамилия сохранилась как языковой артефакт — живое свидетельство местной лексики, которую уже почти не услышишь в живой речи.