Фамилия Мадюжин — редкий образец русской фамилии, образованной от прозвища. В её основе лежит слово «мадюга» или «мадюжий», которое в южнорусских и украинских говорах означало «малорослый, щуплый, невзрачный человек». В некоторых диалектах «мадюга» — это также «неуклюжий, мешковатый» человек. Таким образом, прозвище Мадюга (или Мадюжа) давали человеку за особенности телосложения или манеру держаться. Фамилия отвечает на вопрос «чей?» — сын Мадюги, поэтому в ней суффикс -ин, характерный для фамилий, образованных от слов мужского рода на -а/-я.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий XIX века: прозвищное имя на -уга (ср. Кадюга, Худюга) обрастало уменьшительным суффиксом -ин и превращалось в фамилию. Интересно, что корень «мад-» может иметь и другую природу: в псковских и тверских говорах «мадный» означало «медленный, вялый». Если прозвище пошло оттуда, то Мадюжин — потомок медлительного или флегматичного человека. Обе версии сходятся на том, что фамилия не связана с благородным или профессиональным занятием, а описывает внешность или характер предка.

География фамилии узкая. Мадюжины встречаются в основном в Курской, Белгородской и Воронежской областях, а также на востоке Украины (Сумская, Харьковская области). Это зона, где исторически смешивались южновеликорусские и украинские говоры, что объясняет диалектную основу фамилии. В документах XIX века Мадюжины числятся в основном как государственные крестьяне и однодворцы — потомки служилых людей, охранявших южные рубежи России. Сословная принадлежность невысокая, но устойчивая: в переписных книгах эта фамилия почти не встречается среди дворян или купцов.

Отдельного внимания заслуживает написание. В дореволюционных метрических книгах можно найти варианты «Мадюгин» и «Мадюжин». Первый — более архаичный, от прозвища Мадюга; второй — с суффиксом -жин, который мог возникнуть под влиянием украинского произношения (переход «г» в «ж» перед «и»). Современный вариант Мадюжин закрепился как литературный, хотя в быту фамилия иногда произносится с ударением на второй слог — Мадю́жин, что тоже указывает на южнорусские корни.

В родственном ряду фамилий — Мадюгин, Мадюков, Мадюжкин. Все они образованы от одного корня и означают одно и то же: потомок человека, которого в деревне прозвали за малый рост или медлительность. Никакой тайны или благородной легенды за этой фамилией нет, но она — точный срез народной ономастики, где прозвище, данное «по делу», становилось семейным именем на века.