Фамилия Маджнунян — яркий пример армянской модели фамилии, указывающей на происхождение от отца или предка. Её основа — мужское имя или прозвище Маджнун, а суффикс -ян (классическое армянское окончание, соответствующее русскому -ов/-ев или -ин) означает «принадлежащий к роду такого-то». Таким образом, Маджнунян буквально переводится как «потомок Маджнуна».

Само имя Маджнун имеет арабское происхождение и означает «безумный, одержимый». В арабском и персидском мире это слово стало нарицательным благодаря поэме «Лейли и Маджнун» — истории о безнадёжно влюблённом юноше, который потерял рассудок от любви. В тюркских и кавказских культурах это имя нередко давали как прозвище страстному, влюбчивому или экзальтированному человеку, но чаще — как охранительное имя: считалось, что злые духи не тронут того, кого уже «назвали безумным». В армянской среде, исторически тесно связанной с арабо-персидской культурой, это имя могло попасть через торговые пути или как заимствование у соседних народов.

Суффикс -ян в армянских фамилиях начал закрепляться в XIX веке, особенно после вхождения Восточной Армении в состав Российской империи, когда потребовалась фиксация родовых прозваний. До этого армяне часто обходились именем с указанием отца (например, Маджнун-оглы — «сын Маджнуна»). Фамилия Маджнунян, скорее всего, оформилась именно в этот период, хотя прозвище могло существовать в роду столетиями.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где армянское население долго жило в окружении арабо-тюркской языковой среды: это Западная Армения (исторические области Васпуракан, Туруберан), а также Киликия. После геноцида 1915 года носители фамилии рассеялись по диаспоре — от Ближнего Востока до России и США.

Стоит отметить, что, в отличие от более частых армянских фамилий на -ян, образованных от христианских имён (Петросян, Ованесян), Маджнунян стоит особняком: его основа — мусульманское по происхождению имя, что подчёркивает сложный культурный сплав на Кавказе и в Малой Азии. Других версий происхождения, кроме как от имени-прозвища, для этой фамилии нет — она не связана с ремеслом или местностью.