Фамилия Мафтя — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В первую очередь она цепляет своим нестандартным окончанием. В русской фамильной модели суффикс -я чаще всего указывает на украинское или белорусское происхождение (сравните: Шевченко, Палий, Гончар, но в форме на -я — Палия, Мафтя). Однако в данном случае это не суффикс, а часть корня, что делает фамилию нетипичной для восточнославянского ареала.

Скорее всего, перед нами румынская или молдавская фамилия, перешедшая в русский обиход. В румынском языке слово «mafte» (мн. ч. от «maftă») означает «взятка» или «вымогательство». Соответственно, прозвище Мафтя могли дать человеку, который брал взятки, жил за счёт поборов или был связан с нечистыми на руку делами. В молдавских сёлах такое прозвище могло закрепиться за сборщиком податей, судейским чиновником или просто за жадным и хитрым мужиком. Звучит нелестно, но в те времена прозвища часто были откровенными и не считались оскорблением.

Вторая, менее очевидная версия — от тюркского имени или прозвища. В крымскотатарском и турецком есть корень «mafta» со значением «обманщик», «плут». Фамилия могла закрепиться за выходцами из Крыма или Причерноморья. В этом случае Мафтя — это не прозвище, а адаптированная форма личного имени-характеристики.

В русских документах фамилия почти не встречается. Единичные носители живут на юге России и в Приднестровье, что подтверждает гипотезу о молдавских корнях. Фамилия не склоняется? Нет, она склоняется как существительное мужского рода на -я: Мафти, Мафте, Мафтю. Изначально она, скорее всего, была прозвищной и не имела суффиксальной прибавки — в отличие от типичных русских фамилий на -ов или -ин.