Фамилия Магелан образована от аналогичного прозвища, которое, скорее всего, восходит к румынскому слову magula (magura), что в переводе на русский означает «холм, возвышенность». Согласно этому, можно предположить, что основатель рода жил неподалеку от какой-либо возвышенности или в холмистой местности. Компонент -ан является вариантом румынского суффикса прилагательных -ян (-ean).