Фамилия Магиянова — редкий случай, когда основа слова не бросается в глаза. На первый взгляд, она похожа на множество фамилий на -ов/-ев, образованных от имени или прозвища. Но здесь мы имеем дело с суффиксом -янов, который встречается в русских фамилиях реже и чаще указывает на восточное, тюркское или армянское происхождение.

Корень «Магиян» (или «Магия́н») скорее всего восходит к мужскому имени или прозвищу. В тюркских языках есть корень «маг» (от арабского «маг» — колдун, волшебник), но для фамилии такое прямое значение маловероятно. Более правдоподобна версия, что в основе лежит арабское имя Маги́ (или Маги́й), которое в некоторых мусульманских культурах означало «дарующий», «щедрый». Форма Магиян — это русифицированный вариант с добавлением суффикса принадлежности -ян, характерного для армянских и некоторых тюркских фамилий. В русской среде этот суффикс переосмыслили и добавили к нему окончание -ов, получив типичную русскую модель: Магиянов — «сын Магияна», то есть потомок человека по имени Магиян.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Южному Уралу, где веками жили татары, башкиры и другие тюркские народы, активно контактировавшие с русскими. В этих регионах фамилии на -янов нередко фиксировались у крещёных татар или представителей смешанных семей. Встречаемость фамилии низкая, что подтверждает её локальный характер.

Таким образом, предки носителя фамилии Магиянов с высокой вероятностью были выходцами из тюркской или смешанной этнической среды, а сама фамилия закрепилась в русском языке как отчество от личного имени Магиян, означавшего «щедрый» или «дарующий». Никаких сведений о дворянском происхождении или принадлежности к известным сословиям по этой фамилии нет — она из числа тех, что возникли в крестьянской или мещанской среде, когда фамилии только начинали массово закрепляться в XVIII–XIX веках.